Бежецк исторически был городом льна, и эта специализация отразилась на его промышленности. Однако сегодня главные предприятия города — машиностроительные.
Визитной карточкой считается Бежецкий завод «Автоспецоборудование» (АСО). Он выпускает поршневые и винтовые компрессоры, осушители воздуха, пескоструйное и моечное оборудование для автотранспортных предприятий, сельского хозяйства и коммунальных служб. На заводе работает более 600 человек, а продукция расходится по России и странам СНГ.
«Бежецксельмаш» был, по сути, уникальным для страны заводом техники для уборки и переработки льна — льнокомбайнов и другого оборудования. Год его основания источники называют по-разному: 1943 или 1945. По данным на 2013 год, на заводе работал лишь литейный цех.
Ещё одно известное предприятие — Бежецкий опытно-экспериментальный завод (БОЭЗ). Сведения о его профиле в источниках расходятся: в одних говорится о выпуске мобильных буровых установок для нефтегазовой отрасли, в других — о мини-пекарнях и технологическом оборудовании.
Кроме того, в городе действуют завод железобетонных конструкций, работающий с 1965 года, льнозавод, хлебозавод и молокозавод. Крупнейший новый работодатель района — агропромышленная компания «Коралл», созданная в 2013 году и занимающаяся свиноводством с полным циклом производства.